香港中文大学新成立的「李嘉诚健康科学研究所」的科研焦点主要在跨学科、整合性的研究，以提升健康，防止疾病。研究范围包括疾病的发病机制、诊断、监控、治疗及预防各方面，特别是预防医学、临床医学及再生医学等领域的新进程。研究所的独特之处是利用崭新及跨学科的研究方法，将基础及分子科学的先进研究有效地转化为测试及治疗方案，以救助病人及确保市民健康。

此外，基金会先後两次支持中大医学院并成立「李嘉诚讲座教授席」，首个「李嘉诚讲座教授席」由国际知名医学科学家卢煜明教授出任，卢教授同时为「李嘉诚健康科学研究所」所长；第二个「李嘉诚讲座教授席」则由生理学教授兼上皮细胞生物学研究中心主任陈小章女士担任。

「李嘉诚健康科学研究所」设於沙田威尔斯亲王医院内的临床科研大楼「李嘉诚医学大楼」，2007年9月落成启用。

香港中文大学医学院与李嘉诚基金会曾多次合作，先後在1984年和1997年助建威尔斯教学医院两幢专科诊疗所大楼，并於2001年透过汕头大学与中大医学院合作在汕头成立联合汕头国际眼科中心，为眼病患者提供最先进的治疗服务，并透过医疗技术的输送平台和网络，建立全新的扶贫社会模式。