至於南翼則在95年2月興建，97年6月竣工，同年8月開放公眾啟用。專科診所包括地下共5層，總面積7930平方米，設有70間診症室，裝置先進儀器設備。地下是開放式藥房，1樓及2樓分別是內科及婦產科，3樓及4樓則分別是兒科及眼科，各為市民提供專科門診服務，其他設施還包括治療室、激光室及手術室等。 1999年4月，由基金會捐資興建的本港首個矯形外科及創傷學進修培訓中心正式開幕，該中心設於專科診療所內，利用先進科技及專業知識為骨科醫護人員提供全面而富啟發性的培訓，每年可訓練達500名骨科醫生。
李嘉誠專科診療所(北翼)附設於沙田威爾斯親王醫院南端，1984年5月隨著醫院落成正式開放啟用，內設49間各類全面性專科檢查及診症室，包括內外科、婦產科、兒科、矯形外科、精神科、皮膚科、腫瘤科、眼科、耳鼻喉科等，各分布於四層樓宇內。
至於南翼則在95年2月興建，97年6月竣工，同年8月開放公眾啟用。專科診所包括地下共5層，總面積7930平方米，設有70間診症室，裝置先進儀器設備。地下是開放式藥房，1樓及2樓分別是內科及婦產科，3樓及4樓則分別是兒科及眼科，各為市民提供專科門診服務，其他設施還包括治療室、激光室及手術室等。